Прорыв в поиске лекарств: DrugCLIP от Tsinghua University
Команда из Tsinghua University представила новый AI-фреймворк под названием DrugCLIP, который способен осуществлять поиск лекарственных молекул до 10 миллионов раз быстрее, чем традиционные методы молекулярного докинга. За один день система проверила 500 миллионов молекул на совместимость с 10 000 белков, обработав более 10 триллионов комбинаций с использованием восьми GPU. Это достижение сокращает временные затраты на поиск лекарств, который ранее занимал бы столетия.
DrugCLIP использует метод контрастного обучения, позволяя нейросетям преобразовывать молекулы и белковые карманы в векторы. Близость векторов указывает на соответствие молекулы мишени. В результате команда смогла найти 2 миллиона кандидатов из 10 триллионов пар «белок-молекула», охватив почти половину белок-кодирующего генома человека.
Метод уже был протестирован в лаборатории, где для переносчика норэпинефрина DrugCLIP показал hit rate в 15%. Особенно заметен успех с белком TRIP12, связанным с раком и аутизмом, где hit rate составил 17,5%. За полгода работы фреймворком воспользовались 1 400 исследователей, выполнивших более 13 500 задач по скринингу. Теперь DrugCLIP и база данных доступны для всех ученых, что критически важно, так как около 90% потенциальных мишеней в геноме человека еще не имеют терапии из-за медлительности традиционных методов.